MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes serotype 4b str. LL195

Total Repeats: 66396

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019556	AC	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_019556	T	6	6	221	226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019556	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_019556	A	6	6	301	306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019556	G	7	7	307	313	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019556	CAAT	2	8	322	329	50 %	25 %	0 %	25 %	424712851
7	NC_019556	A	8	8	364	371	100 %	0 %	0 %	0 %	424712851
8	NC_019556	CAA	2	6	407	412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	424712851
9	NC_019556	TAT	2	6	441	446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	424712851
10	NC_019556	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	424712851
11	NC_019556	AGA	2	6	482	487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424712851
12	NC_019556	GAA	2	6	568	573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424712851
13	NC_019556	GCA	2	6	706	711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	424712851
14	NC_019556	GGA	2	6	766	771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	424712851
15	NC_019556	CAA	2	6	820	825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	424712851
16	NC_019556	TTA	2	6	881	886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	424712851
17	NC_019556	ATA	2	6	899	904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	424712851
18	NC_019556	GAA	2	6	910	915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424712851
19	NC_019556	CTTA	2	8	945	952	25 %	50 %	0 %	25 %	424712851
20	NC_019556	TGA	2	6	954	959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712851
21	NC_019556	AAG	2	6	980	985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424712851
22	NC_019556	AC	3	6	1016	1021	50 %	0 %	0 %	50 %	424712851
23	NC_019556	ATG	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712851
24	NC_019556	ATT	3	9	1042	1050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	424712851
25	NC_019556	GACC	2	8	1057	1064	25 %	0 %	25 %	50 %	424712851
26	NC_019556	GAAA	2	8	1068	1075	75 %	0 %	25 %	0 %	424712851
27	NC_019556	CCA	2	6	1138	1143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	424712851
28	NC_019556	A	6	6	1174	1179	100 %	0 %	0 %	0 %	424712851
29	NC_019556	AGT	2	6	1278	1283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712851
30	NC_019556	TTC	2	6	1290	1295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	424712851
31	NC_019556	TAA	2	6	1302	1307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	424712851
32	NC_019556	GCA	2	6	1327	1332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	424712851
33	NC_019556	TTA	2	6	1373	1378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	424712851
34	NC_019556	AAG	2	6	1394	1399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424712851
35	NC_019556	AGA	2	6	1428	1433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424712851
36	NC_019556	A	7	7	1443	1449	100 %	0 %	0 %	0 %	424712851
37	NC_019556	AG	3	6	1498	1503	50 %	0 %	50 %	0 %	424712851
38	NC_019556	TGA	2	6	1533	1538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712851
39	NC_019556	TGG	2	6	1542	1547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	424712851
40	NC_019556	A	6	6	1580	1585	100 %	0 %	0 %	0 %	424712851
41	NC_019556	ACT	2	6	1593	1598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	424712851
42	NC_019556	A	7	7	1640	1646	100 %	0 %	0 %	0 %	424712851
43	NC_019556	CTATTA	2	12	1787	1798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_019556	T	6	6	1805	1810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019556	ATTA	3	12	1811	1822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019556	A	7	7	1849	1855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019556	AAC	2	6	1939	1944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	424712852
48	NC_019556	ATG	2	6	1980	1985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712852
49	NC_019556	ATG	2	6	2052	2057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712852
50	NC_019556	TGG	2	6	2083	2088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	424712852
51	NC_019556	TCAA	2	8	2098	2105	50 %	25 %	0 %	25 %	424712852
52	NC_019556	TCG	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	424712852
53	NC_019556	AGA	2	6	2137	2142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424712852
54	NC_019556	ACCAA	2	10	2172	2181	60 %	0 %	0 %	40 %	424712852
55	NC_019556	TACT	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	424712852
56	NC_019556	TGA	2	6	2452	2457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712852
57	NC_019556	ACA	2	6	2463	2468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	424712852
58	NC_019556	TAAA	2	8	2499	2506	75 %	25 %	0 %	0 %	424712852
59	NC_019556	GAT	2	6	2513	2518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712852
60	NC_019556	CAA	2	6	2548	2553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	424712852
61	NC_019556	TTAAA	2	10	2565	2574	60 %	40 %	0 %	0 %	424712852
62	NC_019556	TAT	2	6	2580	2585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	424712852
63	NC_019556	TAA	2	6	2725	2730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	424712852
64	NC_019556	TTA	2	6	2733	2738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	424712852
65	NC_019556	ATC	2	6	2773	2778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	424712852
66	NC_019556	ATG	2	6	2870	2875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712852
67	NC_019556	TGA	2	6	2899	2904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712852
68	NC_019556	T	7	7	3055	3061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019556	ATG	2	6	3121	3126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712853
70	NC_019556	ACA	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	424712853
71	NC_019556	T	7	7	3161	3167	0 %	100 %	0 %	0 %	424712853
72	NC_019556	GAT	2	6	3216	3221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712853
73	NC_019556	TTG	2	6	3233	3238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	424712853
74	NC_019556	GCTG	2	8	3261	3268	0 %	25 %	50 %	25 %	424712853
75	NC_019556	T	7	7	3294	3300	0 %	100 %	0 %	0 %	424712853
76	NC_019556	ATT	2	6	3313	3318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	424712853
77	NC_019556	GTA	2	6	3343	3348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712853
78	NC_019556	GGT	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	424712853
79	NC_019556	T	6	6	3419	3424	0 %	100 %	0 %	0 %	424712853
80	NC_019556	ATT	2	6	3430	3435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	424712853
81	NC_019556	GAT	2	6	3505	3510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712853
82	NC_019556	CTA	2	6	3512	3517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	424712853
83	NC_019556	T	7	7	3617	3623	0 %	100 %	0 %	0 %	424712853
84	NC_019556	T	6	6	3657	3662	0 %	100 %	0 %	0 %	424712853
85	NC_019556	TA	3	6	3671	3676	50 %	50 %	0 %	0 %	424712853
86	NC_019556	GCT	2	6	3697	3702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	424712853
87	NC_019556	TTCT	2	8	3713	3720	0 %	75 %	0 %	25 %	424712853
88	NC_019556	GCA	2	6	3730	3735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	424712853
89	NC_019556	GC	3	6	3786	3791	0 %	0 %	50 %	50 %	424712853
90	NC_019556	ACT	2	6	3813	3818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	424712853
91	NC_019556	TAA	2	6	3899	3904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	424712853
92	NC_019556	CGG	2	6	3938	3943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	424712853
93	NC_019556	AGC	2	6	3990	3995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	424712853
94	NC_019556	TTC	2	6	3996	4001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	424712853
95	NC_019556	AGT	2	6	4074	4079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712853
96	NC_019556	TTA	2	6	4135	4140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	424712853
97	NC_019556	TTG	2	6	4145	4150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	424712853
98	NC_019556	TTA	2	6	4169	4174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	424712853
99	NC_019556	TTTAT	2	10	4206	4215	20 %	80 %	0 %	0 %	424712853
100	NC_019556	TGT	2	6	4236	4241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	424712853
101	NC_019556	AGTT	2	8	4301	4308	25 %	50 %	25 %	0 %	424712853
102	NC_019556	TGG	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	424712853
103	NC_019556	A	7	7	4436	4442	100 %	0 %	0 %	0 %	424712853
104	NC_019556	TTA	2	6	4448	4453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	424712853
105	NC_019556	A	7	7	4475	4481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019556	T	8	8	4504	4511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019556	AATA	2	8	4512	4519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019556	C	6	6	4524	4529	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
109	NC_019556	A	7	7	4542	4548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019556	AT	3	6	4561	4566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019556	TAT	2	6	4581	4586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	424712854
112	NC_019556	A	7	7	4620	4626	100 %	0 %	0 %	0 %	424712854
113	NC_019556	TGAT	2	8	4702	4709	25 %	50 %	25 %	0 %	424712854
114	NC_019556	TGG	2	6	4721	4726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	424712854
115	NC_019556	AACC	2	8	4976	4983	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_019556	CTTGCA	2	12	5004	5015	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	424712855
117	NC_019556	TAT	2	6	5048	5053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	424712855
118	NC_019556	AGA	2	6	5063	5068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424712855
119	NC_019556	AGA	2	6	5222	5227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424712855
120	NC_019556	ATTT	2	8	5301	5308	25 %	75 %	0 %	0 %	424712855
121	NC_019556	CAA	2	6	5340	5345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	424712855
122	NC_019556	TTCA	2	8	5463	5470	25 %	50 %	0 %	25 %	424712855
123	NC_019556	GCG	2	6	5487	5492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	424712855
124	NC_019556	TCA	2	6	5498	5503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	424712855
125	NC_019556	A	6	6	5602	5607	100 %	0 %	0 %	0 %	424712855
126	NC_019556	AATC	2	8	5611	5618	50 %	25 %	0 %	25 %	424712855
127	NC_019556	GTG	2	6	5638	5643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	424712855
128	NC_019556	GAT	2	6	5667	5672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712855
129	NC_019556	GAA	2	6	5778	5783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424712855
130	NC_019556	TTC	3	9	5800	5808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	424712855
131	NC_019556	GAT	2	6	5811	5816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712855
132	NC_019556	GAT	2	6	5832	5837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712855
133	NC_019556	ACA	2	6	5895	5900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	424712855
134	NC_019556	CAA	2	6	5938	5943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	424712855
135	NC_019556	A	7	7	5969	5975	100 %	0 %	0 %	0 %	424712855
136	NC_019556	TGA	2	6	5999	6004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019556	AAAG	2	8	6006	6013	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019556	AAT	2	6	6022	6027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_019556	ATG	2	6	12090	12095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712858
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